Studijski program doktorskih akademskih studija sadrže obavezne i izborne predmete u ukupnom obimu od 180 ESPB bodova i definisan je Pravilnikom o doktorskim studijama.
1. Projektovanje integrisanih kola (doc.dr Slobodan Petričević)
2. Modelovanje nanostruktura (prof.dr Milan Tadić)
3. Transportni procesi u nanoelektronici i fotonici (prof.dr J. Radunović)
4. Optičke osobine poluprovodničkih heterostruktura (prof.dr V. Milanović, doc.dr Jelena Radovanović)
5. Fotonske komunikacije (prof.dr Dejan Gvozdić)
6. Moderne fotonske komponente i sistemi (prof.dr Petar Matavulj)
7. Fotonski kristali i optički metamaterijali (dr Zoran Jakšić, naučni savetnik IHTM)
8. Spektroskopija čvrstih materijala (dr Zoran Popović, naučni savetnik Instituta za fiziku)
9. Kvantna optika (prof.dr Milan Tadić, dr Branislav Jelenković, nauč.sav.Inst. za fiziku)
10. Modelovanje poluprovodničkih lasera (prof.dr Dejan Gvozdić)
11. Optoelektronske merne metode (prof.dr Jovan Radunović, doc.dr Peđa Mihailović. doc.dr Slobodan Petričević )
12. Prostiranje optičkih talasa u kompleksnim sredinama (prof.dr J. Cvetić)
13. Modelovanje heterostrukturnih mikroelektronskih naprava (dr Petar Lukić, docent Mašinskog fakulteta, dr Rajko Šašić, redovni profesor TMF)
14. Optimizacija i inženjering nanostrukturnih parametara (doc.dr Jelena Radovanović, prof.dr Vitomir Milanović)
15. Električne i optičke karakteristike materijala u nanoelektronici i fotonici (dr Nebojša Romčević, naučni savetnik Instituta za fiziku)
16. Skenirajuća mikroskopija u nanonauci i nanotehnologiji (dr Radoš Gajić, naučni savetnik Instituta za fiziku)
17. Primena plazme u savremenim tehnologijama u elektornici i nauci o materijalima (dr Zoran Petrović, dopisni član SANU, naučni savetnik Instituta za fiziku)
18. Uvod u nelinearnu dinamiku(dr Ljupčo Hadžievski, naučni savetnik Instituta „Vinča")
19. Furijeova optika (prof.dr Jovan Elazar)
20. Nelinearna optika (prof.dr Jovan Elazar)